مشخصات مقاله:
عنوان فارسی مقاله:
کاربرد PCR دیجیتال قطره ای در تشخیص پاتوژن Acidovorax citrulli انتقال یافته به بذر
عنوان انگلیسی مقاله:
Application of droplet digital PCR in detection of seed-transmitted pathogen Acidovorax citrulli
کلمات کلیدی مقاله:
لکه میوه باکتریایی، مرکبات Acidovorax ،PCR دیجیتال قطره ای، تشخیص بذر، PCR کمی در زمان واقعی
مناسب برای رشته های دانشگاهی زیر:
مهندسی کشاورزی
مناسب برای گرایش های دانشگاهی زیر:
ژنتیک مولکولی و مهندسی ژنتیک، علوم و تکنولوژی بذر، بیماری شناسی گیاهی
وضعیت مقاله انگلیسی و ترجمه:
مقاله انگلیسی را میتوانید به صورت رایگان با فرمت PDF با کلیک بر روی دکمه آبی، دانلود نمایید. برای ثبت سفارش ترجمه نیز روی دکلمه قرمز رنگ کلیک نمایید. سفارش ترجمه نیازمند زمان بوده و ترجمه این مقاله آماده نمیباشد و پس از اتمام ترجمه، فایل ورد تایپ شده قابل دانلود خواهد بود.
فهرست مطالب:
Abstract
Keywords
References
قسمتی از مقاله انگلیسی:
Abstract
Bacterial fruit blotch caused by Acidovorax citrulli is a serious threat to cucurbit industry worldwide. The pathogen is seedtransmitted, so seed detection to prevent distribution of contaminated seed is crucial in disease management. In this study, we adapted a quantitative real-time PCR (qPCR) assay to droplet digital PCR (ddPCR) format for A. citrulli detection by optimizing reaction conditions. The performance of ddPCR in detecting A. citrulli pure culture, DNA, infested watermelon/ melon seed and commercial seed samples were compared with multiplex PCR, qPCR, and dilution plating method. The lowest concentrations detected (LCD) by ddPCR reached up to 2 fg DNA, and 102 CFU mL–1 bacterial cells, which were ten times more sensitive than those of the qPCR. When testing artificially infested watermelon and melon seed, 0.1% infestation level was detectable using ddPCR and dilution plating method. The 26 positive samples were identified in 201 commercial seed samples through ddPCR, which was the highest positive number among all the methods. High detection sensitivity achieved by ddPCR demonstrated a promising technique for improving seed-transmitted pathogen detection threshold in the future.
دانلود رایگان مقاله انگلیسی سفارش ترجمه تخصصی مقاله