مشخصات مقاله:
عنوان فارسی مقاله:
ترکیب فناوری های وب معنایی با سیستم های چند واسطه ای برای دسترسی یکپارچه به منابع زیستی
عنوان انگلیسی مقاله:
Combining Semantic Web technologies with Multi-Agent Systems for integrated access to biological resources
کلمات کلیدی مقاله:
بیوانفورماتیک، هستی شناسی، وب معنایی، چند سیستم عامل، خدمات وب معنایی، داده ناهمگن
مناسب برای رشته های دانشگاهی زیر:
مهندسی فناوری اطلاعات و مهندسی کامپیوتر
مناسب برای گرایش های دانشگاهی زیر:
اینترنت و شبکه های گسترده و سیستم های چند رسانه ای
وضعیت مقاله انگلیسی و ترجمه:
مقاله انگلیسی را میتوانید به صورت رایگان با فرمت PDF از باکس زیر دانلود نمایید. ترجمه این مقاله با فرمت WORD – DOC آماده خریداری و دانلود آنی میباشد.
فهرست مطالب:
چکیده
مقدمه
سابقه
سیستم های چند واسطه ای و خدمات وب معنایی
فناوری واسطه
فناوری های وب معنایی
بیوانفورماتیک
اطلاعات زیستی و منابع دانش
پایگاه داده های زیستی
آنتولوژی زیستی
چارچوبی برای عوامل هوشمند و ادغام خدمات وب معنایی
نمایش آنتولوژی محور
مدل چند لایه ای
چارچوب SEMMAS
معماری SEMMAS
فرآیند مبادله
بحث
استفاده از SEMMAS در دامنه زیستی
دامنه زیستی: انکوژنها
طراحی خدمات وب معنایی برای منابع زیستی
آنتولوژی ژن خدمات وب معنایی
بازیابی اطلاعات زیستی با SEMMAS: استفاده از سناریو موردی
نتیجه گیری و کار آینده
قسمتی از مقاله انگلیسی و ترجمه آن:
1. Introduction
There is currently a huge volume of biomedical and genomic data Internet-available [1]. However, data are distributed into heterogeneous biological data sources, with little or even none information organisation. Therefore, integration and exchange of data within and among organisations is a universally recognised need in bioinformatics [2]. One of the major obstacles for integration efforts in bioinformatics is that relevant information is widely distributed, both across the Internet and within individual organisations. Besides, it can be found in a variety of storage formats, including structured and semi-structured ones. The Semantic Web [3] provides a common framework that enables for data integration, sharing and reuse from multiple sources. Particularly, the use of ontologies [4] for domain knowledge representation can help bioinformatics in solving the heterogeneity problem. On the other hand, goal-driven architectures and service-based, loosely-coupled infrastructures have proved to be very useful when dealing with data and functionality integration from different and disparate sources. Web Services are the leading technology for developing service-oriented architectures. They provide the means for universal, remote execution of functionality. The breakthrough of adding semantics to Web Services leads to the Semantic Web Services paradigm [5]. Semantic Web Services technology enables the automation of service discovery, composition, invocation and monitoring. However, potential users might deter from using Semantic Web Services since their underlying formalisation and unease of use hampers its use from rich user-interaction perspective.
1. مقدمه
در حال حاضر حجم عظیمی از اطلاعات پزشکی و ژنومی در اینترنت [1] وجود دارد. با این حال، داده ها در منابع داده های زیستی ناهمگن با سازماندهی اطلاعات کم و یا حتی بدون آن توزیع شده اند. بنابراین، ادغام و تبادل اطلاعات در داخل و در میان سازمان یک نیاز جهانی به رسمیت شناخته شده در بیوانفورماتیک [2] است. یکی از موانع اصلی عملیات ادغام در بیوانفورماتیک این است که اطلاعات مربوطه به طور گسترده ای، هم در اینترنت و هم در درون سازمان های شخصی پراکنده است. علاوه بر این، می توان آن را به صورت های مختلف ذخیره سازی، مثل موارد ساختار یافته و نیمه ساختار یافته مشاهده نمود.
وب معنایی [3] یک چارچوب متعارفی را ایجاد می کند که قادر است یکپارچه سازی داده ها، اشتراک گذاری و استفاده مجدد از منابع مختلف را انجام دهد. به خصوص، استفاده از آنتولوژی [4] برای نمایندگی گستره دانش می تواند به بیوانفورماتیک در حل مشکل عدم تجانس کمک کند. از سوی دیگر، معماری هدف محور و مبتنی بر خدمات، زیرساخت های عمومی ممزوج را اثبات کرده اند در هنگام برخورد با داده ها و یکپارچه سازی قابلیت ها از منابع مختلف و متفاوت بسیار مفید است. خدمات وب، فناوری های پیشرویی برای توسعه معماری خدمات گرا است. آنها ابزاری جهانی را برای اجرای از راه دور کارکردها ارائه می کنند. توفیق اضافه کردن معانی به خدمات وب، منجر به الگوی خدمات وب معنایی می شود [5]. فناوری خدمات وب معنایی اتوماسیون کشف، ترکیب، احضار و نظارت خدمات را ممکن می سازد. با این حال، کاربران ممکن است از کاربرد خدمات وب معنایی منع شوند چون که شکل رسمی و مشتاقانه استفاده از آن کاربری آن را از دیدگاه تواسطه غنی کاربر مختل می کند.