مشخصات مقاله:
عنوان فارسی مقاله:
مقایسه روش های استخراج مستقیم DNA میکروبی از خاک های مختلف شالیزار
عنوان انگلیسی مقاله:
Comparisons of direct extraction methods of microbial DNA from different paddy soils
کلمات کلیدی مقاله:
روش استخراج، DNA میکروبی، پاکسازی، خاک پودری
مناسب برای رشته های دانشگاهی زیر:
کشاورزی
مناسب برای گرایش های دانشگاهی زیر:
بیولوژی و بیوتکنولوژی خاک، شیمی خاک و علوم خاک
وضعیت مقاله انگلیسی و ترجمه:
مقاله انگلیسی را میتوانید به صورت رایگان با فرمت PDF از باکس زیر دانلود نمایید. ترجمه این مقاله با فرمت WORD – DOC آماده خریداری و دانلود آنی میباشد.
فهرست مطالب:
چکیده
1- مقدمه
2- مواد و روش ها
2-1- جمع آوری نمونه
2-2- استخراج DNA خاک
2-3- ارزیابی کیفیت و کمیت DNA
2-4- خالص سازی DNA
2-5- تجزیه و تحلیل های آماری
3- نتایج و بحث
4- نتیجه گیری
قسمتی از مقاله انگلیسی و ترجمه آن:
1. Introduction
Microbial communities play a critical role in maintaining soil productivity by regulating the cycling, retention and release of major nutrients in soil (Torsvik and Øvrea˚s, 2002; Islam et al., 2011). But till to date, up to 99% of the microbes present in soil are neither cultivable nor accessible for basic biotechnological research (Knietsch et al., 2003; Lakay et al., 2007). Conventional approaches currently being used appear to be inaccurate, and the results obtained hardly indicate comprehensive profile of soil microbial diversity in situ (Luo et al., 2003). On the other hand, molecular techniques such as PCR amplification of 16S rRNA genes or other genes of ecological significance yield relatively less biased information about microbial communities than traditional culturing approaches. Therefore, molecular analyses of microbial communities in complex environmental samples such as soil warrant efficient unbiased DNA extraction procedures.
1- مقدمه:
جمعیت های میکروبی نقش حیاتی را در حفظ حاصلخیزی خاک با تنظیم چرخه، حفظ و رهاسازی مواد غذایی اساسی در خاک ایفا می کنند (Torsvik and Øvrea˚s, 2002; Islam et al., 2011). اما تا کنون تا 99 درصد از میکروب های موجود در خاک، برای پژوهش های پایه ای بیوتکنولوژی نه قابل کشت هستند و نه قابل دسترس (Knietsch et al., 2003; Lakay et al., 2007). روش های مرسومی که در حال حاضر استفاده می شوند ظاهرا دقیق نیستند و نتایج به دست آمده به سختی پروفایل جامعی از تنوع میکروبی in situ خاک را نشان می دهند (Luo et al., 2003). از طرف دیگر، تکنیک های مولکولی مثل تکثیر PCR ژن های 16S rRNA و سایر ژن های مهم اکولوژیکی، نسبت به روش های سنتی تر، اطلاعات نسبتا کم مربوط به جمعیت های میکروبی را افزایش می دهد. بنابراین آنالیزهای مولکولی جمعیت های میکروبی در نمونه های ترکیبی محیطی مثل خاک، روش های کارآمد استخراج DNA را تضمین می کند.